体内循环性预存抗体所引发的快速应答，也是固有免疫应答的一个方面。抗体可以产生于固有免疫之后的适应性应答，也可以被活跃于固有免疫中的B1细胞亚群所产生(详后)。此类抗体主要是IgM，针对TI抗原。B1细胞及抗TI抗体的存在，参与了对入侵病原体的快速应答，机制是启用补体途径裂解病原体。由于PAMP所包含的成分为病原体的共同结构，因而某一病原体感染后诱导的IgM抗体，也可全部或部分地对新人侵的病原体起反应。
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然而，需要警惕的是机体内可能存在一些与PAMP结构有交叉反应的自身成分。例子之一是ABO血型抗原。该抗原由乙酰氨基葡萄糖及半乳糖基等组成寡糖前体，加上岩藻糖基构成血型H抗原，然后在乙酰氨基半乳糖基转移酶或半乳糖基转移酶的作用下成为红细胞血型A抗原和B抗原。它们与病原体表面的糖类结构十分相似。对此结构，大多数模式识别分子并不与之起反应，因为即使是专一性识别各种糖类的MBI。，如果糖链端部不在特定部位显示羟基结构，则不能被其PRD结构域所识别。然而曾被菌体糖类多表位激发的预存IgM抗体，却有可能发挥作用。所以输血必需配型，防止供者A型血进入B型受者体内，因天然抗A抗体的作用而发生血液凝结。
